Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChmlQ9QZD5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmlQ9QZD5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms