Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr4a3Q9QZB6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms