Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ubxn8Q9QZ49 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn8Q9QZ49 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms