Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Exo1Q9QZ11 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms