Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bcl11aQ9QYE3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11aQ9QYE3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms