Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nphp1Q9QY53 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms