Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd4Q9QY39 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd4Q9QY39 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms