Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nufip1Q9QXX8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nufip1Q9QXX8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms