Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy2Q9QXT0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms