Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK9

Sh2d2a, SH2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d2aQ9QXK9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d2aQ9QXK9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d2aQ9QXK9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms