Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Apbb1Q9QXJ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb1Q9QXJ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms