Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacl1Q9QXE0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacl1Q9QXE0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms