Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpc5Q9QX29 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms