Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dkk3Q9QUN9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms