Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms