Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl2Q9QUK0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl2Q9QUK0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms