Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sfmbt1Q9JMD1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms