Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrfQ9JM73 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms