Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh9a1Q9JLJ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh9a1Q9JLJ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh9a1Q9JLJ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms