Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nectin3Q9JLB9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin3Q9JLB9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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