Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsmQ9JL96 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsmQ9JL96 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms