Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms