Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx6Q9JKK1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms