Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms