Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem1Q9JKE2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms