Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms