Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ybx3Q9JKB3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ybx3Q9JKB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms