Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uchl3Q9JKB1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms