Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard6bQ9JK83 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms