Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Alyref2Q9JJW6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Alyref2Q9JJW6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Alyref2Q9JJW6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Alyref2Q9JJW6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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