Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gfra4Q9JJT2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms