Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl3Q9JJR7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms