Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FliiQ9JJ28 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms