Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc22Q9JIG7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms