Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Exosc9Q9JHI7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms