Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHG6

Rcan1, Calcipressin-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan1Q9JHG6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan1Q9JHG6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan1Q9JHG6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan1Q9JHG6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan1Q9JHG6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan1Q9JHG6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rcan1Q9JHG6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rcan1Q9JHG6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rcan1Q9JHG6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan1Q9JHG6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms