Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brd4Q9ESU6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brd4Q9ESU6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brd4Q9ESU6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms