Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn10Q9ESK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn10Q9ESK3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn10Q9ESK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn10Q9ESK3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn10Q9ESK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn10Q9ESK3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn10Q9ESK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn10Q9ESK3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn10Q9ESK3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms