Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ropn1Q9ESG2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ropn1Q9ESG2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms