Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfip11Q9ERA6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms