Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capn12Q9ER56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capn12Q9ER56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms