Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rapgef4Q9EQZ6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rapgef4Q9EQZ6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms