Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ndst3Q9EQH7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ndst3Q9EQH7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ndst3Q9EQH7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ndst3Q9EQH7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ndst3Q9EQH7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ndst3Q9EQH7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndst3Q9EQH7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ndst3Q9EQH7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ndst3Q9EQH7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ndst3Q9EQH7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndst3Q9EQH7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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