Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms