Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms