Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SyncQ9EPM5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SyncQ9EPM5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms