Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mmp1bQ9EPL6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp1bQ9EPL6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms