Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft1Q9DCN7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms