Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc97Q9DBT3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms