Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Swt1Q9DBQ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Swt1Q9DBQ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 343.7 ms